A Escola João Paulo II inicia suas atividades em 17 de janeiro de 2012 no prédio da Organização Movimento Renovador Paulo VI do qual é filial, oferecendo a educação infantil e ensino fundamental anos inicias. O desejo da continuidade do ensino nasceu do coração dos pais que ao ver uma educação de qualidade e com valores não poderia parar ali. 

A partir disso a Diretoria do Movimento Renovador Paulo VI reuniu-se para encontrar um meio de dar continuidade e para isso seria necessário a construção de um novo prédio. Por ser uma instituição sem fins lucrativos, não havia recursos financeiros para realizar a obra. No entanto a diretoria iniciou pedidos de oração e novenas por meio da intercessão de João Paulo II para a construção da nova escola.

A construção se deu devido aos parceiros do Movimento Renovador Paulo VI, Irmã Fides e o Padre Thomas Brown, que acreditaram no projeto da escola e forneceram o apoio financeiro para realização desse sonho.

A graça foi acontecendo, pois, mesmo a irmã Fides em idade avançada já num leito na Alemanha continuou nos apoiando financeiramente até o término da construção. Consideramos a construção desse novo prédio mais um milagre do Papa João Paulo II.

Em honra a graça alcançada se deu o nome da escola, escolhido pela Sra. Maria Vani Pedroso de Oliveira que é devota e admiradora do Papa, pelo seu carisma, a luta pela paz, a relação com a juventude católica mostrando um carinho especial para com os jovens desde seus primeiros dias do sacerdócio e por exercer influência para melhorar o diálogo inter-religioso.

Desde então no mês de outubro a escola relembra a história do Papa João Paulo II e realiza uma celebração de ação de graças pela conquista da construção da escola.